PuTTY Keygen で SSH キーを生成できますか。

はい、できます。

PuTTY Keygen で生成した SSH キーを Titan FTP Server で読込むには、同時に秘密鍵も読込んでください。

読込み時に「秘密鍵情報のインポート」にチェックを入れて、秘密鍵も読込んでください。

Titan FTP Server ホストキーインポート

秘密鍵のフォーマットは OpenSSH としてください。